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唐永凯,李建林,李红霞,陈雪峰,俞菊华.2008.奥利亚罗非鱼EF-1α基因的克隆与结构分析.动物学杂志,43(5):7-12.
奥利亚罗非鱼EF-1α基因的克隆与结构分析
Cloning and Gene Construction Analysis of EF-1α in Oreochromis aureus
投稿时间:2008-03-13  修订日期:2008-06-24
DOI:
中文关键词:  奥利亚罗非鱼  克隆  EF-1α
英文关键词:Oreochromis aureus  Clone  EF-1α
基金项目:中央级基本科研业务费专项项目(No.2007JBFC03);江苏省自然科学基金项目(No.BK2006029)
作者单位
唐永凯 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室 无锡 214081 
李建林 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室 无锡 214081 
李红霞 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室 无锡 214081 
陈雪峰 南京农业大学 南京 210095 
俞菊华 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室 无锡 214081 
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中文摘要:
      真核生物延伸生长因子基因(EF-1α)在蛋白质翻译过程中起着重要的作用,其序列具有高度的保守性,是一种管家基因。本文通过RT-PCR克隆出奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)EF-1α的部分cDNA序列,其长度为425bp,翻译成141个氨基酸,计算的蛋白质分子量为15.1ku。同源性分析显示,奥利亚罗非鱼EF-1α氨基酸序列与尼罗罗非鱼(O.niloticus)的相似性最高,为100%;与青(鱼将)(Oryzias latipes)、欧洲鲈(Dicentrarchus labrax)、斑马鱼(Danio rerio)、鲑鱼(Salmo trutta)的相似性分别为92%、91%、85%、82%;与小鼠(Mus musculus)、大鼠(Rattus norvegicus)、人(Homo sapiens)、鸡(Gallus gallus)的相似性均为85%。同时克隆出奥利亚罗非鱼EF-1α相应的DNA序列,共506bp。cDNA与DNA的序列比对显示克隆出的奥利亚罗非鱼EF-1α含有1个内含子,这为将来设计EF-1α荧光定量引物以及测定其在不同组织中的表达量变化打下基础。
英文摘要:
      Eukaryotic elongation factor 1α(EF-1α)plays an important role in translation and its sequence is highly conservative as a housekeeping gene.The partial cDNA encoding EF-1α in Oreochromis aureus was isolated using RT-PCR.The cDNA encoding 141 amino acids with a calculated molecular weight of 15.1 ku was 425 bp.The comparison of the deduced amino acid sequence of O.aureus EF-1α with that of O.niloticus,Oryzias latipes,Dicentrarchus labrax,Danio rerio or Salmo trutta showed that the homology rates were 100%,92%,91%,85%,and 82%,respectively,while the amino acids homology was 85% when comparing O.aureus with Mus musculus,Homo sapiens,Gallus gallus,or Rattus norvegicus.The DNA sequence of O.aureus EF-1α consisting of 506 bp was also cloned.Comparing the partial cDNA to its genomic sequence revealed that O.aureus EF-1α gene consisted of an intron,which supplied useful information in designing the EF-1α primer in real time RT-PCR and calculating the EF-1α expression in different tissues.
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